L’AFGC est est née en 2007 de la fusion du « groupe de génétique médicale du 3ème jeudi » et du « club de conseil génétique de langue française ».
Le groupe du 3ème jeudi avait été créé en 1971, à l’initiative des pionniers de la Génétique clinique en France qui se retrouvaient à l’Hôpital Necker–enfants malades à Paris tous les mois (accueillis par l’équipe du Pr Frézal) pour partager leurs cas difficiles de dysmorphologie et assurer entre eux leur formation continue.
Parallèlement, le club de conseil génétique de langue française créé en 1972 à Lyon par le Professeur Robert était plus orienté vers le conseil génétique et réunissaient des généticiens européens ayant comme point commun d’être francophones.
